GCMS-QP2010 Plus在工厂通过了瞬间断电的测试。在一个电源周期当中，不会发生故障，比如对于50Hz来说一个周期就是20msec。诸如信号传输错误，真空错误的 发生大约出现在100msec以后，同时正在进行的分析将被停止。对于那种持续性的意外断电GCMS设备将处于停止状态；对于间歇性的意外断电，GCMS 将会在电源恢复时重新启动(此时各部分的温度不会上升)；对于频繁的意外断电，GCMS将不会启动真空。
　　长达十数小时甚至几十小时的意外断电 可能会造成MS部分的污染。这些污染主要来自于机械泵油的扩散，由于负压的作用,机械泵油的蒸汽可能会被倒吸入真空腔体内。为了减少这种危险的发生，岛津 公司的GCMS系统具有 ” Vacuum Restart Mode(真空自动重启) ” 功能。在意外断电之前将 ” Vacuum Restart Mode(真空自动重启) ” 功能打开(此时的真空系统应处于 ” Ready ” 状态)。在遭遇意外断电又再次来电的时候, “ 自动启动电路 “ 将动作，真空系统可以得到恢复，但此时为安全考虑，离子源和GC部分的温度不会上升。如果不启动这个功能，MS的真空系统部分不会启动。
另外，在电源恢复时GC部分将按照 ” Start Mode(启动模式) ” 进行重启。” Semi-Auto(半自动) ”是GCMS系统中的常用设定：载气自动打开，柱前压恢复到意外断电之前的设定值。其它的GC单元(比如进样口、柱温箱)由于没有自动打开而不会升温。
　　不管怎样，意外断电会导致分析停止，损失宝贵的样品，为避免损失，我们推荐使用不间断电源(UPS)。